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第一篇:酵母文库相关问题十问十答FAQ1: 在溶解AbA时,可以用DMSO(二甲基亚砜)么? 答:不能,需要用无水乙醇。 FAQ2: 膜体系文库筛选,做自激活检测的时候,阴性对照为什么在三缺四缺也正常生长? 答:如果只是轻微生长是有可能的,膜体系系统中的阴性对照,有时候由于菌的活力太强,培养时间太久,涂板的菌液量大等原因,导致在三缺、四缺上会有轻微生长,但长势会明显弱于阳性对照,只要功能验证生长正常,没有自激活,就可以进行后续筛库。 FAQ3: 如何验证一个蛋白是否具有转录激活活性? FAQ4: 拟南芥全长转录因子库,双杂和单杂诱饵载体及菌株分别是用什么? 答:双杂 BD 载体可用 pDEST32、菌株用 Y2HGold;单杂 BD 载体 用pHISi-1、菌株 用YM4271。 FAQ5: 如果研究的诱饵蛋白亚细胞定位在线粒体上,用核体系酵母文库还是膜体系酵母文库筛选比较好? 答:可以先尝试用膜系统酵母文库筛选,但前提该蛋白须有一个末端在细胞质里。 FAQ6: PlantCare网站是预测植物启动子的结构原件,是否可以预测昆虫或者其他动物的? 答:理论上不行,但是都是预测软件可以参考使用。 FAQ7:在做自激活检测的时候,为什么平板的克隆大小不均一? 答:克隆生长密度和生长时间都会让克隆大小不均一,生长稀疏的地方营养丰富,克隆会偏大,但是不影响结果判断。 FAQ8: 做核体系酵母单杂筛选的时候,一般启动子区域如何选择?串联3次的结构元件筛选是不是自激活更容易抑制? 答:经过大量单杂筛选实验,经验告知我们启动子的长短选择对于本身的自激活现象,两者本身没有直接的线性关系,具体的选择可能还是取决于我们后期主要研究的序列。 FAQ9: 核体系单杂筛选的空载pAbAi为什么不能用作阴性对照?又为什么连了目的片段自激活就可以抑制住? 答:第一:空载pAbAi本身是有自激活, 第二:外源片段可以破坏掉多克隆位点区域的序列 FAQ10:做酵母文库双杂筛选实验中,为什么后续筛到阳性克隆,进过测序发现阳性克隆序列与诱饵载体BD的序列是相同的? 答:实验中是有这种现象的,因为有的蛋白会以二聚体的形式进行互作。 |